Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms