Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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TCIRG1Q13488 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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