Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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CHAF1AQ13111 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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