Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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