Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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MKRN3Q13064 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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