Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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