Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPRBP23467 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPRBP23467 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPRBP23467 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRBP23467 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRBP23467 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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