Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTLA4P16410 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTLA4P16410 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CTLA4P16410 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTLA4P16410 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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