Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SH3BP1Q9Y3L3 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SH3BP1Q9Y3L3 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SH3BP1Q9Y3L3 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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SH3BP1Q9Y3L3 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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