Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CTXN3Q4LDR2 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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