Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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COL24A1Q17RW2 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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