Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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VAMP3Q15836 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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VAMP3Q15836 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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