Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SYCP1Q15431 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SYCP1Q15431 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SYCP1Q15431 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SYCP1Q15431 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SYCP1Q15431 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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