Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms