Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms