Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms