Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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