Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms