Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms