Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMFRQ9UKV5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms