Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CCDC180Q9P1Z9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CCDC180Q9P1Z9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms