Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms