Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms