Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms