Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms