Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LCORQ96JN0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms