Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms