Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L4Q8WU68 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms