Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL22A1Q8NFW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms