Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC2Q8N158 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms