Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms