Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms