Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3BQ7Z3V4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms