Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms