Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms