Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIF1Q5UIP0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIF1Q5UIP0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms