Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HES3Q5TGS1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HES3Q5TGS1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms