Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms