Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP170Q5SW79 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CEP170Q5SW79 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms