Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD3Q5JV73 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms