Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms