Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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