Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS72Q15906 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS72Q15906 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms