Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
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