Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms