Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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