Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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