Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN3Q13286 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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