Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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