Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN3Q13064 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN3Q13064 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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